CAS番号で検索してヒットした物質を下書き状態で登録した後、物質名のみを変更することはできますか？

可能です。

物質追加後、物質の詳細画面を開き、「化学名または一般名」の横にある鉛筆マークをクリックして、物質名を変更することができます。

ただし、労働安全衛生法によって、物質の特定を妨げるような物質名表示は禁止されておりますので、ご注意ください。